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生技~PCR應用中RFLPs與RAPD功能差異?


問題


請幫我說明PCR應用中RFLPs與RAPD功能差異?其中有一點RFLPs可以做為醫學上親緣的鑑定RAPD可以判定品種品系這兩種功能好像是一樣的還是有分別???麻煩糾正我的觀念謝謝


最佳解答


RFLP 目前已經被 STR 取代其醫學上的親緣關係鑑定地位了喔! 目前國際通用的DNA鑑定方法多採用短縱重複序列(STR)系統,ABO血型、HLA或是RFLP等方式,因為鑑別能力低或耗時長,已少採用。 STR是存在於個體內正常變異的序列,相同的STR區塊在不同個體間,會有長短不一的差異,此種不同的長短序列主要是因為該基因內核甘酸序列的重複次數有的多、有的少所導致。國際目前是以美國調查局的COSDIS 13型為基礎,發展出15型(不包含AMEL基因點)適合用於人別鑑定的STR基因點位,且針對每一個點位進行詳細的族群分析,建立族群的分布資料庫,據以進行親緣的統計分析。(http://www.genephile.com.tw/PT/htm/id-system.htm) 至於 RAPD 在判定品種品系的準確度比 RFLP 高一點, 不過後來被更新的 AFLP (Amplified fragment length polymorphism )取代 DNA sequencing 則 是 最 直 接 的 檢 測 方 法 ﹐ 由 核 酸 序 列 來 直 接 比 對 兩 者 之 間 的 差 異 。 此 方 法 也 是 近 年 來 最 被 大 多 數 人 採 用 的 方 法 。 然 而 核 酸 的 序 列 相 當 龐 大 ﹐ 不 可能 將 所 有 的 核 酸 序 列 全 面 性 的 解出﹐ 所 以 目 的 基 因 的 選 取 則 變 得 格 外 的 重 要 。 目 的 基 因 要 相 當 的 具 有 保 留 性 ( conserved )﹐這 種 保 留 性 可 以 讓 我 們 能 夠 區 別 種 內 與 種 間 的 差 異 甚 而 不 同 族 群 間 的 差 異 。 一 般 來 說 用 於 族 群 變 異 研 究 的 目 的 基 因 有 針 對 細 胞 核 內 的 genomic DNA 的 ribosomal DNA internal transcribed spacer ( ITS ) regions ( Chang et al., 11996 ), exons of the major histocompatibility complex ( MHC ) ( Miller et al., 1997 ), 及 microsatellite loci ( Painter et al., 1997; Hughes and Deloach, 1997 ), 也 有 針 對 粒 腺 體 的 DNA 中 16S ribosomal DNA 的 序 列( Geller et al., 1997 ), cytochrome b gene ( Hardy et al., 1995 ), 及 mitochondrial control region ( Petri et al., 1996; Brown Gladden et al., 1997; Fumagalli et al., 1997 ) 。


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